RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486856.5

IFT80-222, Transcript of intraflagellar transport 80, human

TSL 4

Gene IFT80, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT80-222	ENST00000486856	AMT	P48728	403 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	OLR1	P78380	273 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	EGR4	Q05215	589 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	TRAF1	Q13077	416 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	HNF4G	Q14541	408 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SHB	Q15464	509 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	LINGO2	Q7L985	606 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SHF	Q7M4L6	423 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PELI3	Q8N2H9	469 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	BEST2	Q8NFU1	509 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	GPT2	Q8TD30	523 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	TRIB2	Q92519	343 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SNAPC3	Q92966	411 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	TXNDC15	Q96J42	360 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ZNF570	Q96NI8	536 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PROCR	Q9UNN8	238 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		3.44	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PIEZO1	Q92508	2521 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ALPK3	Q96L96	1907 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856		A0A1W2PRG0	241 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	LACTBL1	A8MY62	500 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	INAFM1	C9JVW0	142 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	TIMM23	O14925	209 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SEC14L5	O43304	696 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	KLK8	O60259	260 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SERPINI2	O75830	405 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	CH25H	O95992	272 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ARL3	P36405	182 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PMS2	P54278	862 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	GRIK3	Q13003	919 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	MYBPC2	Q14324	1141 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	NEDD9	Q14511	834 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	KRT32	Q14532	448 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	FJX1	Q86VR8	437 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	FAM122A	Q96E09	287 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	STRA6	Q9BX79	667 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ASAH2	Q9NR71	780 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	HAO1	Q9UJM8	370 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	MKLN1	Q9UL63	735 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		3.43	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	USP47	Q96K76	1375 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	CCDC7	Q96M83	1385 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856		A0A1B0GVM2	712 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SNAP23	O00161	211 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	WNT9B	O14905	357 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	KCNJ13	O60928	360 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	VNN2	O95498	520 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PRSS2	P07478	247 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	HOXC6	P09630	235 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	AGA	P20933	346 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ARRB2	P32121	409 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	PCYT1A	P49585	367 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	CXCR3	P49682	368 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	HTR6	P50406	440 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ERV3-1	Q14264	604 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	TSSK4	Q6SA08	328 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		3.42	□□□□□ -1.86
IFT80-222	ENST00000486856	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms