RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476594.1

CCM2-208, Transcript of CCM2 scaffold protein, human

TSL 3

Gene CCM2, Length 533 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCM2-208	ENST00000476594	PERM1	Q5SV97	790 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	CCNJL	Q8IV13	435 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF567	Q8N184	647 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	PELI3	Q8N2H9	469 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	IPMK	Q8NFU5	416 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	ACTL9	Q8TC94	416 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	FGF11	Q92914	225 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	TMEM159	Q96B96	161 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	TADA1	Q96BN2	335 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	COX14	Q96I36	57 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	TTC25	Q96NG3	672 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	GBA3	Q9H227	469 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	RAX	Q9Y2V3	346 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	PKP3	Q9Y446	797 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	APC2	O95996	2303 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	OR5K4	A6NMS3	321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	C2orf81	A6NN90	581 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594		D6RAR5	112 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	KCNN4	O15554	427 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	VEGFD	O43915	354 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	NOBOX	O60393	691 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	BRINP1	O60477	761 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	SOD1	P00441	154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	RBL1	P28749	1068 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	GPR3	P46089	330 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	INHBC	P55103	352 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	ITGA9	Q13797	1035 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	SLC1A5	Q15758	541 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	PYCR3	Q53H96	274 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	BROX	Q5VW32	411 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	ALS2CL	Q60I27	953 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	TMEM139	Q8IV31	216 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	GDAP1	Q8TB36	358 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	GLYATL1	Q969I3	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	UBP1	Q9NZI7	540 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594		A0A087WV48	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594		A0A0U1RQS6	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	GRID2	O43424	1007 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	NUAK1	O60285	661 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	KRT37	O76014	449 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	ECEL1	O95672	775 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	CRTAM	O95727	393 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	CPNE6	O95741	557 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	CAPNS1	P04632	268 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	MPO	P05164	745 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	CCDC175	P0C221	793 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	PIRT	P0C851	137 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	CCKBR	P32239	447 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	SPAM1	P38567	509 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	POLD2	P49005	469 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	UCN	P55089	124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	IHH	Q14623	411 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	PTPRR	Q15256	657 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CCM2-208	ENST00000476594	P3H1	Q32P28	736 aa		10.12	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms