RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474172.1

SETX-204, Transcript of senataxin, humanhuman

TSL 3

Gene SETX, Length 719 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-204ENST00000474172 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 TTC7BQ86TV6 843 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 CACUL1Q86Y37 369 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 NUDCD3Q8IVD9 361 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SLC44A3Q8N4M1 653 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 CLDN19Q8N6F1 224 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 PAF1Q8N7H5 531 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ZNF398Q8TD17 642 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 LRRC8CQ8TDW0 803 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 UBXN10Q96LJ8 280 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 GPR21Q99679 349 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ASB8Q9H765 288 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 KCNK13Q9HB14 408 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 KCNK12Q9HB15 430 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 HEBP1Q9NRV9 189 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 COPG2Q9UBF2 871 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 DKK3Q9UBP4 350 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SERGEFQ9UGK8 458 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 PLA2G4CQ9UP65 541 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 FAM50BQ9Y247 325 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ACOT9Q9Y305 439 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 PKP3Q9Y446 797 aa10□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 AGAP14A8MT82 685 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SGTAO43765 313 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 MTX2O75431 263 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 NDUFS3O75489 264 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 RHOBTB1O94844 696 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 KLHL2O95198 593 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 TSPAN12O95859 305 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 APODP05090 189 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 EPHX1P07099 455 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 GSTA1P08263 222 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 CPA3P15088 417 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 CRABP2P29373 138 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 PMLP29590 882 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 CTHP32929 405 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 DRD3P35462 400 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SPAM1P38567 509 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 MMP12P39900 470 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 NNMTP40261 264 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 PSMD8P48556 350 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 POLD2P49005 469 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 TAS2R38P59533 333 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ST8SIA6P61647 398 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 OCRLQ01968 901 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 RAD51Q06609 339 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 NFATC2Q13469 925 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ITGA9Q13797 1035 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ZSCAN26Q16670 478 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 USP45Q70EL2 814 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ISCA2Q86U28 154 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 AADATQ8N5Z0 425 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 KDM1BQ8NB78 822 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 TMIEQ8NEW7 156 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SCYL1Q96KG9 808 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 GUCD1Q96NT3 240 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SORT1Q99523 831 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 CD248Q9HCU0 757 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 XPR1Q9UBH6 696 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 TLK1Q9UKI8 766 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.99□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 NUMA1Q14980 2115 aa9.98□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 F5P12259 2224 aa9.98□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.98□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 A0A087X1B8 175 aa9.98□□□□□ -0.81
SETX-204ENST00000474172 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms