RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470258.5

NHLRC3-203, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,298 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-203ENST00000470258 ARHGAP17Q68EM7 881 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 BNIPLQ7Z465 357 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SLC38A6Q8IZM9 456 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 FBXO30Q8TB52 745 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.895e-7■■■■□ 24.2
NHLRC3-203ENST00000470258 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 HSFY1Q96LI6 401 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ZNF560Q96MR9 790 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 GPR78Q96P69 363 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ALG9Q9H6U8 611 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 INVSQ9Y283 1065 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 RIPK3Q9Y572 518 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 U3KQV3 271 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 TTC34A8MYJ7 566 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 CENPBD1B2RD01 187 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 G3V2T6 193 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SLC1A7O00341 560 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PPP6CO00743 305 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PIP5K1BO14986 540 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 KMOO15229 486 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ALPLP05186 524 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 CYP4B1P13584 511 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PTPN3P26045 913 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 HADHAP40939 763 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 KRT6CP48668 564 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SULT1E1P49888 294 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ARPP19P56211 112 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PSMD5Q16401 504 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 STRADAQ7RTN6 431 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 LEMD2Q8NC56 503 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 TTC16Q8NEE8 873 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 GPRASP2Q96D09 838 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 KCNA7Q96RP8 456 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PLSCR3Q9NRY6 295 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ARID2Q68CP9 1835 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 CENPXA8MT69 81 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 LACTBL1A8MY62 500 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 DPYSL4O14531 572 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 CRCPO75575 148 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 RGS20O76081 388 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 DIO3P55073 304 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 KCNK10P57789 538 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 OR4D2P58180 307 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 GNG2P59768 71 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 GLYATQ6IB77 296 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ITFG1Q8TB96 612 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 YME1L1Q96TA2 773 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SP140LQ9H930 580 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SATB2Q9UPW6 733 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PSME4Q14997 1843 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 GABARAPO95166 117 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 JCHAINP01591 159 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PRKACBP22694 351 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 CHRNB3Q05901 458 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 BST2Q10589 180 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 UGP2Q16851 508 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 DACT2Q5SW24 774 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 FAAH2Q6GMR7 532 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 PODNQ7Z5L7 613 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 CADM2Q8N3J6 435 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 SVOPQ8N4V2 548 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 IPMKQ8NFU5 416 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 FAR1Q8WVX9 515 aa9.49□□□□□ -0.89
NHLRC3-203ENST00000470258 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms