RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 DKK4Q9UBT3 224 aa7.34□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.34□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SOX13Q9UN79 622 aa7.34□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.34□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1B0GTH6 734 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PQF6 199 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PQH9 124 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC12A8A0AV02 714 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TBC1D3BA6NDS4 549 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CENPBD1B2RD01 187 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CAPN9O14815 690 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GPR39O43194 453 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 THAP12O43422 761 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GREM1O60565 184 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TSPAN3O60637 253 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ZBED1O96006 694 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 DNTTP04053 509 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ADH5P11766 374 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 HOXB2P14652 356 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GRIA2P42262 883 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GPD2P43304 727 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 KRT6CP48668 564 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 RGS7P49802 495 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CLDN6P56747 220 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 DAOAP59103 153 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TUBB4BP68371 445 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 BNC1Q01954 994 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CDK18Q07002 472 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PWP1Q13610 501 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GALEQ14376 348 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GRTP1Q5TC63 336 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 FYB2Q5VWT5 728 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PMF1Q6P1K2 205 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 AAGABQ6PD74 315 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 XKR5Q6UX68 686 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ADCK1Q86TW2 530 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC47A2Q86VL8 602 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF276Q8N554 614 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 UBA3Q8TBC4 463 aa7.33□□□□□ -1.24
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RPUSD3-212ENST00000466141 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM71BQ8TC56 605 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 STARD8Q92502 1023 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 WBP2Q969T9 261 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 FUT8Q9BYC5 575 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.33□□□□□ -1.24
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RPUSD3-212ENST00000466141 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 RAD54BQ9Y620 910 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CKAP5Q14008 2032 aa7.33□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PQC6 194 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 E7ENQ6 273 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 J3QKU1 62 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 M0R3H8 397 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TK2O00142 265 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 AREL1O15033 823 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 MDM4O15151 490 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TEX33O43247 280 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 MED7O43513 233 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TBX18O95935 607 aa7.32□□□□□ -1.24
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