RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462548.6

RPRD1B-203, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 5

Gene RPRD1B, Length 2,436 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-203ENST00000462548 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 SUOXP51687 545 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ENPP2Q13822 863 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 CHI3L2Q15782 390 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 Q7L0L9 218 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 DPPA4Q7L190 304 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ZNF398Q8TD17 642 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 SLC30A3Q99726 388 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 KCNK12Q9HB15 430 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 COPG2Q9UBF2 871 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 APPL1Q9UKG1 709 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 BIRC5O15392 142 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 NIPSNAP2O75323 286 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.021e-10■■□□□ 12.9
RPRD1B-203ENST00000462548 GM2AP17900 193 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ITGB7P26010 798 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 CTHP32929 405 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 MMP12P39900 470 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ARHGEF7Q14155 803 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 CCDC153Q494R4 210 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 PPM1EQ8WY54 764 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 FAM50BQ9Y247 325 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.91□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 AGAP14A8MT82 685 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 TARM1B6A8C7 271 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 RHOBTB1O94844 696 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 IL1BP01584 269 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 CCDC166P0CW27 439 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 CPA3P15088 417 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ITGALP20701 1170 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 Q6ZVL8 140 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 SCAMP4Q969E2 229 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ABCG8Q9H221 673 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 IQCF5A8MTL0 148 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ASGR2P07307 311 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 NEFHP12036 1026 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ZNF30P17039 623 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ACRV1P26436 265 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 TIE1P35590 1138 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ETV3P41162 512 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 PTGER3P43115 390 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 BST1Q10588 318 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 C2orf27AQ580R0 203 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 CHPFQ8IZ52 775 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 SCYL1Q96KG9 808 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 GPR21Q99679 349 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 XPR1Q9UBH6 696 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 SUN2Q9UH99 717 aa14.9□□□□□ -0.02
RPRD1B-203ENST00000462548 CKAP5Q14008 2032 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 KLF11O14901 512 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 EGFP01133 1207 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 TNFRSF4P43489 277 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 PSMD8P48556 350 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 PTPN5P54829 565 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 PON2Q15165 354 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 LIPIQ6XZB0 460 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 NXPE1Q8N323 547 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 PLXNA2O75051 1894 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 MYO10Q9HD67 2058 aa14.89□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 SNX3O60493 162 aa14.88□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 ZSCAN26Q16670 478 aa14.88□□□□□ -0.03
RPRD1B-203ENST00000462548 GPR33Q49SQ1 333 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms