RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 DEXIO95424 95 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ITGB3P05106 788 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL4P13236 92 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LMO2P25791 158 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CHMLP26374 656 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HTR1BP28222 390 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SERPINB3P29508 390 aa4.09□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.09□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 IL37Q9NZH6 218 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 RNF215Q9Y6U7 377 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.761e-8■■■■■ 34.9
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ECHDC1-211ENST00000460558 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.08□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 NRG3P56975 720 aa4.08□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 GTF3C1Q12789 2109 aa4.08□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 ERV3-1Q14264 604 aa4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MST1LQ2TV78 715 aa4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 DCAF12Q5T6F0 453 aa4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 NEK5Q6P3R8 708 aa4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 GCNT7Q6ZNI0 430 aa4.08□□□□□ -1.76
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