RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 TTPAP49638 278 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 MTAPQ13126 283 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 GPR33Q49SQ1 333 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 TMEM31Q5JXX7 168 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 SERPINA9Q86WD7 417 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 PGBD3Q8N328 593 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 DTX3LQ8TDB6 740 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 EDAQ92838 391 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
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NME4-209ENST00000460297 CRYL1Q9Y2S2 319 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 TECTAO75443 2155 aa24.09■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 DBN1Q16643 649 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 TAOK1Q7L7X3 1001 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 PELI3Q8N2H9 469 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 DCLK2Q8N568 766 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 LPGAT1Q92604 370 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 AP2M1Q96CW1 435 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 MTBPQ96DY7 904 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 NUS1Q96E22 293 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 GPR22Q99680 433 aa24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NME4-209ENST00000460297 PRR23AA6NEV1 266 aa24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 FADS2P1A8MWK0 482 aa24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 ACRV1P26436 265 aa24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 ATP5DP30049 168 aa24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 ACSL1P33121 698 aa24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 ITGA9Q13797 1035 aa24.08■■□□□ 1.44
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NME4-209ENST00000460297 CERS6Q6ZMG9 384 aa24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 ZNF765Q7L2R6 523 aa24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 NXPE1Q8N323 547 aa24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TRAM1L1Q8N609 369 aa24.08■■□□□ 1.44
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NME4-209ENST00000460297 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.08■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 OR1I1O60431 355 aa24.07■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 NDUFS3O75489 264 aa24.07■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TM7SF2O76062 418 aa24.07■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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NME4-209ENST00000460297 ZNF284Q2VY69 593 aa24.07■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.07■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 ZNF549Q6P9A3 640 aa24.07■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa24.07■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 PREBQ9HCU5 417 aa24.07■■□□□ 1.44
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NME4-209ENST00000460297 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TBC1D3EA0A087X179 549 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TBC1D3LB9A6J9 549 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 RFPL1O75677 317 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 IGLV3-19P01714 112 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TBC1D3HP0C7X1 549 aa24.06■■□□□ 1.44
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NME4-209ENST00000460297 FGL2Q14314 439 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TIFABQ6ZNK6 161 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 NDNQ99608 321 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.06■■□□□ 1.44
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NME4-209ENST00000460297 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa24.06■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa24.05■■□□□ 1.44
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NME4-209ENST00000460297 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 K7ESM1 405 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 PI15O43692 258 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 SOD1P00441 154 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 MT-ND3P03897 115 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 CLCN5P51795 746 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 RPS21P63220 83 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 AGERQ15109 404 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 SH2D5Q6ZV89 423 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 BOCQ9BWV1 1114 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 BTBD1Q9H0C5 482 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 DCXO43602 365 aa24.05■■□□□ 1.44
NME4-209ENST00000460297 PTGER3P43115 390 aa24.05■■□□□ 1.44
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