RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 ECHS1P30084 290 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 GABRDO14764 452 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 KCNE1P15382 129 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MYL12AP19105 171 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CDC42P60953 191 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 IL23RQ5VWK5 629 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ROPN1LQ96C74 230 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 USP46P62068 366 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 LIPEQ05469 1076 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PAOXQ6QHF9 649 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 C9JVG2 144 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MYL12BO14950 172 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TBX10O75333 385 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 EOMESO95936 686 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 IFNGR2P38484 337 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CXCR3P49682 368 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 BLVRAP53004 296 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ABCG8Q9H221 673 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ACADMP11310 421 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ITGA2P17301 1181 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 G3V2T6 193 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PIP5K1BO14986 540 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CLTBP09497 229 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ITGADQ13349 1161 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 KCTD21Q4G0X4 260 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 EMC10Q5UCC4 262 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 VPS4AQ9UN37 437 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RGS20O76081 388 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 BMP10O95393 424 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 EPORP19235 508 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CCNA2P20248 432 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NTSP30990 170 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MPPE1Q53F39 396 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ZBTB2Q8N680 514 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TIFAQ96CG3 184 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 STRA6Q9BX79 667 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NEMP2A6NFY4 417 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 HCRTO43612 131 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TYROBPO43914 113 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PRAMEF1O95521 474 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 HPGDP15428 266 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TALDO1P37837 337 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SPAM1P38567 509 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CENPAP49450 140 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NACC2Q96BF6 587 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 APOLD1Q96LR9 279 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 HLA-DQB2P05538 268 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 GPIP06744 558 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MPP2Q14168 576 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms