RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 APOL2Q9BQE5 337 aa23.72■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 GBA3Q9H227 469 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa23.71■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 ACTR1AP61163 376 aa23.71■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 C19orf48Q6RUI8 117 aa23.71■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
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SH3BP5-208ENST00000459627 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-208ENST00000459627 CCNJLQ8IV13 435 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-208ENST00000459627 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
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SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA13Q96N96 652 aa23.67■■□□□ 1.38
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