RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 ALG6Q9Y672 507 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 BSNQ9UPA5 3926 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PSTPIP1O43586 416 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FTCDO95954 541 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PEX11BO96011 259 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 GP1BBP13224 206 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MX2P20592 715 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ALDH4A1P30038 563 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ETV5P41161 510 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CASRP41180 1078 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CSNK1DP48730 415 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MARCKSL1P49006 195 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 POLE2P56282 527 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MC1RQ01726 317 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 AP1B1Q10567 949 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NR1D2Q14995 579 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 AMZ1Q400G9 498 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NPNTQ6UXI9 565 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PGBD5Q8N414 524 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 OR1E3Q8WZA6 343 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 VOPP1Q96AW1 172 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 WDR24Q96S15 920 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SLC12A9Q9BXP2 914 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NOD2Q9HC29 1040 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FGF22Q9HCT0 170 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 DTLQ9NZJ0 730 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PRSS38A1L453 326 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 A8MX80 341 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 AGRPO00253 132 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CPP00450 1065 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CCNB1P14635 433 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CASQ1P31415 396 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TRIM23P36406 574 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CYP4F2P78329 520 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 GPLD1P80108 840 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 B4GALNT1Q00973 533 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SEPT6Q14141 434 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 DCAF12Q5T6F0 453 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CCDC181Q5TID7 509 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 DENND2CQ68D51 928 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PEX26Q7Z412 305 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CCDC13Q8IYE1 715 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PLD5Q8N7P1 536 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 OR4D9Q8NGE8 314 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 HTR3CQ8WXA8 447 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NKD1Q969G9 470 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 HAUS1Q96CS2 278 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MGME1Q9BQP7 344 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CEP41Q9BYV8 373 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RDH14Q9HBH5 336 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.553e-10■□□□□ 10.4
PRAME-210ENST00000442481 AMFRQ9UKV5 643 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 LRRK1Q38SD2 2015 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TMEM202A6NGA9 273 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 B4E171 279 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 KCNK1O00180 336 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MATN3O15232 486 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CST8O60676 142 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CCNCP24863 283 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 UGT1A3P35503 534 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN7P41732 249 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 LIMK2P53671 638 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 DSC2Q02487 901 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms