RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 XYLBO75191 536 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 OR4F21O95013 312 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 S1PR4O95977 384 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 RPL34P49207 117 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 DGCR6Q14129 220 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 TTC9BQ8N6N2 239 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR21Q99679 349 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 PLGRKTQ9HBL7 147 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CDH9Q9ULB4 789 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 AP3B1O00203 1094 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 GSTA4O15217 222 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 NDUFS3O75489 264 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CD52P31358 61 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 RENBPP51606 427 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 RPL26P61254 145 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 TSPY1Q01534 308 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CREB5Q02930 508 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 NACA2Q9H009 215 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 OSER1Q9NX31 292 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 XIRP2A4UGR9 3374 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 HHLA1C9JL84 531 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC22A2O15244 555 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 OR1I1O60431 355 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 NIPSNAP2O75323 286 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP4B1P13584 511 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 NR1D2Q14995 579 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPRNQ16849 979 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 GNASQ5JWF2 1037 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ATAD1Q8NBU5 361 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 IL12RB2Q99665 862 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 APOL5Q9BWW9 433 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ASB1Q9Y576 335 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 GMNNO75496 209 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ODC1P11926 461 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ITIH5Q86UX2 942 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ADGRG5Q8IZF4 528 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 SDCCAG3Q96C92 435 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 PRKD2Q9BZL6 878 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 WDR90Q96KV7 1748 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CD1DP15813 335 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 HCAR3P49019 387 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CD300CQ08708 224 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CBLBQ13191 982 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 NR6A1Q15406 480 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBED5Q49AG3 693 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 GLYATQ6IB77 296 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 OR52B6Q8NGF0 335 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 NSMCE2Q96MF7 247 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 E5RI56 91 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 C1RP00736 705 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 MATN1P21941 496 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 HMOX2P30519 316 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 THPOP40225 353 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ALDH3B2P48448 385 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 HK2P52789 917 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 SELPLGQ14242 412 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 SPESP1Q6UW49 350 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 IL27RAQ6UWB1 636 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CDC26Q8NHZ8 85 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM8A1Q9UBU6 413 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 K7EPI3 171 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 FXYD1O00168 92 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ADRA1AP35348 466 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 TBX4P57082 545 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJB13P59910 316 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 SEMG2Q02383 582 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 FPGSQ05932 587 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CBX3Q13185 183 aa18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms