RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389993.7

PSME4-201, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSME4, Length 6,581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-201ENST00000389993 ANPEPP15144 967 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CREMQ03060 361 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ANGPT1Q15389 498 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 DPYSL2Q16555 572 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PIGRP01833 764 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CSF2RAP15509 400 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SPAM1P38567 509 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PHF21AQ96BD5 680 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 BORCS6Q96GS4 357 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TPST2O60704 377 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ITGB1P05556 798 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MTA1Q13330 715 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 OTCP00480 354 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 GGT5P36269 586 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 EPS8Q12929 822 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 H3BM21 787 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 APODP05090 189 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MPP4Q96JB8 637 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SUSD3Q96L08 255 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TEKT5Q96M29 485 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SH3GL2Q99962 352 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 BDH2Q9BUT1 245 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CYLDQ9NQC7 956 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 VAV1P15498 845 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CES1P23141 567 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 KRT20P35900 424 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SERPINB10P48595 397 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CAP1Q01518 475 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TGM3Q08188 693 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 DEF8Q6ZN54 512 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 KRT78Q8N1N4 520 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CLDND1Q9NY35 253 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 RFXANKO14593 260 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 RPN2P04844 631 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 RPIAP49247 311 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 DGKGP49619 791 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PRKAA2P54646 552 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 AIF1P55008 147 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 STX19Q8N4C7 294 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 HCSTQ9UBK5 93 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 STYXQ8WUJ0 223 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 REPS1Q96D71 796 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CACNA1SQ13698 1873 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PIP5K1BO14986 540 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 OR10H2O60403 315 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 FSBPO95073 299 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 DLGAP3O95886 979 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 NRIP1P48552 1158 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 HK2P52789 917 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 GPM6BQ13491 265 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 LMLNQ96KR4 655 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.49□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CLDN7O95471 211 aa14.48□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ETS2P15036 469 aa14.48□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 LIMK2P53671 638 aa14.48□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 GPX6P59796 221 aa14.48□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CSNK2BP67870 215 aa14.48□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.091e-8■■■□□ 18.2
PSME4-201ENST00000389993 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.48□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.48□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PROX1Q92786 737 aa14.48□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 OR2AG1Q9H205 316 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms