RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384238.1

RNU6-5P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 5, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-5P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-5P-201ENST00000384238 IFNL4K9M1U5 179 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 HS3ST1O14792 307 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 MID1O15344 667 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 GPC4O75487 556 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PPP1R3DO95685 299 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 EGFP01133 1207 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 LINC00271P0C7V0 271 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 IL7RP16871 459 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 USP8P40818 1118 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 IL15P40933 162 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 TAS2R40P59535 323 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PDE1BQ01064 536 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ACSM2AQ08AH3 577 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 MED22Q15528 200 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CDONQ4KMG0 1287 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 C9orf57Q5W0N0 161 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 JADE1Q6IE81 842 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PRSS57Q6UWY2 283 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ARMC9Q7Z3E5 817 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 SFR1Q86XK3 245 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 EPHX4Q8IUS5 362 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 FOXRED2Q8IWF2 684 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CCDC13Q8IYE1 715 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ANKRD52Q8NB46 1076 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 RND1Q92730 232 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 APBB2Q92870 758 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 TAAR8Q969N4 342 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ORAI1Q96D31 301 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CDCA5Q96FF9 252 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 TMEM19Q96HH6 336 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 C1orf74Q96LT6 269 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CMTM3Q96MX0 182 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 QRFPRQ96P65 431 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 EBF2Q9HAK2 575 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 NOX4Q9NPH5 578 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 C1RLQ9NZP8 487 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 COPG2Q9UBF2 871 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 OR14J1Q9UGF5 321 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 TINAGQ9UJW2 476 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ZNF580Q9UK33 172 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 POU2F3Q9UKI9 436 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 AMDHD2Q9Y303 409 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CHD1O14646 1710 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CFAP43Q8NDM7 1665 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 A8MZ25 164 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 M0QZ24 198 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CLGNO14967 610 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 KCNN4O15554 427 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 HS6ST1O60243 411 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PTP4A3O75365 173 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 KDM4BO94953 1096 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 RARGP13631 454 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PLA2G2AP14555 144 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 S1PR1P21453 382 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PSMB10P40306 273 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 UBA7P41226 1012 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 TMPOP42166 694 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PDLIM4P50479 330 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 TERF1P54274 439 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 RRP1P56182 461 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 TROAPQ12815 778 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 COASYQ13057 564 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 RALBP1Q15311 655 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 SYT16Q17RD7 645 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 WBP2NLQ6ICG8 309 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 MZT2BQ6NZ67 158 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 TUBA1AQ71U36 451 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 TSPAN33Q86UF1 283 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 GPR180Q86V85 440 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 ADGRF2Q8IZF7 708 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 BEST3Q8N1M1 668 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-5P-201ENST00000384238 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.7 ms