RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384017.1

RNU6-620P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 620, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-620P, Length 96 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-620P-201ENST00000384017 GAGE5Q13069 117 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GAGE6Q13070 117 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 IHHQ14623 411 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GARNL3Q5VVW2 1013 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ACSM2BQ68CK6 577 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ARSKQ6UWY0 536 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GATAD2AQ86YP4 633 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 SLC25A41Q8N5S1 370 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 AQP11Q8NBQ7 271 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 OR1P1Q8NH06 330 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 XAGE5Q8WWM1 108 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ASB15Q8WXK1 588 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 RMDN1Q96DB5 314 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 P2RY11Q96G91 374 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 CLMNQ96JQ2 1002 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 MRGPRX4Q96LA9 322 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ZNF597Q96LX8 424 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 TSNARE1Q96NA8 513 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 LRFN5Q96NI6 719 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 DDOQ99489 341 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 FOXC2Q99958 501 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 XKR8Q9H6D3 395 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 NANOGQ9H9S0 305 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 NOX4Q9NPH5 578 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ANO2Q9NQ90 1003 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 FAM206AQ9NX38 181 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 RNF186Q9NXI6 227 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 C1RLQ9NZP8 487 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ETV7Q9Y603 341 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 IGSF1Q8N6C5 1336 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GSG1L2A8MUP6 293 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 IGLL5B9A064 214 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GOLGA6L22H0YM25 854 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 H3BRB1 525 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 PRDM1O75626 825 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GAGE7O76087 117 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 MMP2P08253 660 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ACSM4P0C7M7 580 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GAGE12FP0CL80 117 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GAGE12GP0CL81 117 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GAGE12IP0CL82 117 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GNAT1P11488 350 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ST6GAL1P15907 406 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 NCLP19338 710 aaKnown RBP-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 HNF1AP20823 631 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ABCD3P28288 659 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 SSTR2P30874 369 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 RPS10P46783 165 aaKnown RBP-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 CDK7P50613 346 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ST8SIA6P61647 398 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ACTA2P62736 377 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ACTC1P68032 377 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 TMPRSS15P98073 1019 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ECT2LQ008S8 904 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 RUNX1Q01196 453 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 SP3Q02447 781 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 KRT17Q04695 432 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 RELQ04864 619 aaPredicted RBP-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GAGE1Q13065 139 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GAGE4Q13068 117 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 PGM5Q15124 567 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 E2F5Q15329 346 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 CYP1B1Q16678 543 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GTDC1Q4AE62 458 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 JADE1Q6IE81 842 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 KIAA1841Q6NSI8 718 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 CGB2Q6NT52 195 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 MRNIPQ6NTE8 343 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 Q6ZRP5 223 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 RDH10Q8IZV5 341 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 CEND1Q8N111 149 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 FITM2Q8N6M3 262 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 DNAAF1Q8NEP3 725 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 CFAP61Q8NHU2 1237 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ZNF519Q8TB69 540 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ZNF480Q8WV37 535 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 SNX33Q8WV41 574 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 GTSF1Q8WW33 167 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 ARHGEF26Q96DR7 871 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 TMEM19Q96HH6 336 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 AGAP4Q96P64 663 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 CITED4Q96RK1 184 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 PKMYT1Q99640 499 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 FOXB1Q99853 325 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-620P-201ENST00000384017 TINF2Q9BSI4 451 aa-3.05□□□□□ -2.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms