RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 SERPINF2P08697 491 aa25.18■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 PRKCZQ05513 592 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 HM13Q8TCT9 377 aa25.18■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 SLC10A3P09131 477 aa25.17■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 OR1G1P47890 313 aa25.17■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 COQ5Q5HYK3 327 aa25.17■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 RIMKLBQ9ULI2 386 aa25.17■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 GPR45Q9Y5Y3 372 aa25.17■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 ARPC2O15144 300 aa25.16■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 PDFQ9HBH1 243 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 TIMM22Q9Y584 194 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 ECI2O75521 394 aa25.15■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 OXTRP30559 389 aa25.15■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 CCDC68Q9H2F9 335 aa25.15■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 CDH15P55291 814 aa25.15■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 ADGRG5Q8IZF4 528 aa25.15■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 TRIB3Q96RU7 358 aa25.15■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 NKX3-2P78367 333 aa25.14■■□□□ 1.62
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C9orf40-201ENST00000376854 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.14■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 TRIM54Q9BYV2 358 aa25.14■■□□□ 1.62
C9orf40-201ENST00000376854 A0A0D9SEW6 157 aa25.14■■□□□ 1.61
C9orf40-201ENST00000376854 A0A1W2PP18 115 aa25.14■■□□□ 1.61
C9orf40-201ENST00000376854 CDC7O00311 574 aa25.14■■□□□ 1.61
C9orf40-201ENST00000376854 RPS17P08708 135 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
C9orf40-201ENST00000376854 ELNP15502 786 aa25.14■■□□□ 1.61
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
C9orf40-201ENST00000376854 KCNK10P57789 538 aa25.14■■□□□ 1.61
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