RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 KCNC4Q03721 635 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PMS2P3Q13401 168 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PFKFB4Q16877 469 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 HMBOX1Q6NT76 420 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FBXL22Q6P050 247 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF280BQ86YH2 543 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 DDIASQ8IXT1 998 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF683Q8IZ20 524 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ARRDC2Q8TBH0 407 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SOCS4Q8WXH5 440 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TOP1MTQ969P6 601 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SLCO4A1Q96BD0 722 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 L3HYPDHQ96EM0 354 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ERVK-6Q9BXR3 956 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 AKTIPQ9H8T0 292 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SARDHQ9UL12 918 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC14BA6NHZ5 514 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 NR5A2O00482 541 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PPP6CO00743 305 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SOCS2O14508 198 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 LSM1O15116 133 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CD1DP15813 335 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PAX3P23760 479 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 OR1G1P47890 313 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 MAPK10P53779 464 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 HUNKP57058 714 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SH3BP2P78314 561 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GALNT3Q14435 633 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 NHSL2Q5HYW2 709 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 MSANTD2Q6P1R3 559 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 C17orf99Q6UX52 265 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GALNT7Q86SF2 657 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 DHFR2Q86XF0 187 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SLC15A4Q8N697 577 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SCAIQ8N9R8 606 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 EFHD1Q9BUP0 239 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CD300AQ9UGN4 299 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 NOD1Q9Y239 953 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.13□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM64CA6NLI5 447 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF839A8K0R7 811 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 UBXN8O00124 270 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 B4GALT3O60512 393 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GFAPP14136 432 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SLC7A1P30825 629 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 OR1E1P30953 314 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ACVRL1P37023 503 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SLC26A3P40879 764 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ARPP19P56211 112 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 MRNIPQ6NTE8 343 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF549Q6P9A3 640 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CYHR1Q6ZMK1 362 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TEX26Q8N6G2 289 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 OR13C4Q8NGS5 318 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 BTN2A3PQ96KV6 586 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SLC12A8A0AV02 714 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SOAT2O75908 522 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GPX3P22352 226 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FDXRP22570 491 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GRIA3P42263 894 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GNA12Q03113 381 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 IL10RBQ08334 325 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF235Q14590 738 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RAB39AQ14964 217 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RGS21Q2M5E4 152 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 C10orf120Q5SQS8 335 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FAM110BQ8TC76 370 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GNPTGQ9UJJ9 305 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa13.12□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0J9YYE9 177 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms