RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 HPS6Q86YV9 775 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 OR5T2Q8NGG2 359 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 ARHGAP23Q9P227 1491 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 GCNT6Q5T4J0 391 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 BORAQ6PGQ7 559 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 NCSTNQ92542 709 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 SLC35C1Q96A29 364 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 ISOC1Q96CN7 298 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 FEM1CQ96JP0 617 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 ARL5BQ96KC2 179 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 CIB1Q99828 191 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.49□□□□□ -1.53
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