RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305264.7

HDAC3-201, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDAC3, Length 1,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-201ENST00000305264 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 SNX20Q7Z614 316 aa26.96■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 NLRP8Q86W28 1048 aa26.96■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 ZNF398Q8TD17 642 aa26.96■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 DTX3LQ8TDB6 740 aa26.96■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 MOCS1Q9NZB8 636 aa26.96■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 POM121BA6NF01 834 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 ITGALP20701 1170 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 NUDT1P36639 197 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 CACNG1Q06432 222 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 SEMA3AQ14563 771 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 PDPK2PQ6A1A2 396 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 GCNT7Q6ZNI0 430 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 CATSPERZQ9NTU4 200 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 SLC17A6Q9P2U8 582 aa26.95■■□□□ 1.91
HDAC3-201ENST00000305264 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 RIPK2O43353 540 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 PIAS1O75925 651 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 GSTA2P09210 222 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 TSHRP16473 764 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 ITGA9Q13797 1035 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 BRD3Q15059 726 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 SGSM3Q96HU1 749 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 SLC6A18Q96N87 628 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 OR1A2Q9Y585 309 aa26.95■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 CCDC151A5D8V7 595 aa26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 INPP4BO15327 924 aa26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 SPAG6O75602 509 aa26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 F7P08709 466 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 MAP9Q49MG5 647 aa26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 SPDYCQ5MJ68 293 aa26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 NEPROQ6NW34 567 aa26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 FBF1Q8TES7 1133 aa26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 R4GN57 208 aa26.94■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 AGAP14A8MT82 685 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 FPGTO14772 594 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 C1QAP02745 245 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 UQCRHP07919 91 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 ZNF470Q6ECI4 717 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 HEATR4Q86WZ0 1026 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 OTUD6BQ8N6M0 293 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 BMFQ96LC9 184 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 SMYD2Q9NRG4 433 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 CRLS1Q9UJA2 301 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 ITPKAP23677 461 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 LYSMD4Q5XG99 296 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 TAS2R42Q7RTR8 314 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 TRIM74Q86UV6 250 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 RGL4Q8IZJ4 473 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 PRSS33Q8NF86 280 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 DNASE2BQ8WZ79 361 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 VPS35Q96QK1 796 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 WDR26Q9H7D7 661 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 ARFGAP3Q9NP61 516 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 SMOXQ9NWM0 555 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 STX2P32856 288 aa26.92■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 TRIM23P36406 574 aa26.92■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 DENND6AQ8IWF6 608 aa26.92■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 C1orf216Q8TAB5 229 aa26.92■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 GLYATL1Q969I3 302 aa26.92■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 LGR4Q9BXB1 951 aa26.92■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 PYGLP06737 847 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 PHBP35232 272 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 SLC1A2P43004 574 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 CDK3Q00526 305 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 MGAT5Q09328 741 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.94e-7■■■■■ 33.4
HDAC3-201ENST00000305264 GPR33Q49SQ1 333 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 WDR45BQ5MNZ6 344 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 PRR23BQ6ZRT6 265 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 SERPINA9Q86WD7 417 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 NXPE1Q8N323 547 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 BTN2A2Q8WVV5 523 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 ERLIN1O75477 346 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 TEAD1P28347 426 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 HSD17B3P37058 310 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 TCF15Q12870 199 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC3-201ENST00000305264 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa26.91■■□□□ 1.9
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