RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 GDF3Q9NR23 364 aa22.07■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.07■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 NCDNQ9UBB6 729 aa22.07■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.07■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.07■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CFAP54Q96N23 3096 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 TMEM202A6NGA9 273 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 NDC80O14777 642 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 MTX2O75431 263 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PSMA3P25788 255 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ECHS1P30084 290 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 LAMB3Q13751 1172 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC25Q86WR0 208 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF398Q8TD17 642 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ASB8Q9H765 288 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 APPL1Q9UKG1 709 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ARNTP27540 789 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 C21orf59P57076 290 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CAV1Q03135 178 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ACVR1Q04771 509 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 NFATC2Q13469 925 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 TMEM135Q86UB9 458 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 IQCHQ86VS3 1027 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CEP76Q8TAP6 659 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 GPR27Q9NS67 375 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SPEGQ15772 3267 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 MAGEB16A2A368 324 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 H7C0S8 307 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 VAPBO95292 243 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 POLD2P49005 469 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 THOP1P52888 689 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 TEAD4Q15561 434 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 DOK6Q6PKX4 331 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 NAT14Q8WUY8 206 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 HIC2Q96JB3 615 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 E7ESA3 106 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 DPP6P42658 865 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 NXPH1P58417 271 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 YPEL5P62699 121 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PRAMEP78395 509 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 GRIK2Q13002 908 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 IFT20Q8IY31 132 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 GLYATL1Q969I3 302 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 NFU1Q9UMS0 254 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC6A14Q9UN76 642 aa22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SCAMP1O15126 338 aa22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 OVGP1Q12889 678 aa22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 FZD2Q14332 565 aa22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 NFATC4Q14934 902 aa22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CENPUQ71F23 418 aa22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PEX13Q92968 403 aa22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CFAP36Q96G28 342 aa22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1-201ENST00000298466 COX14Q96I36 57 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms