RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 GAGE1Q13065 139 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GAGE4Q13068 117 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ITGADQ13349 1161 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 EFNB3Q15768 340 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 STPG1Q5TH74 334 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CNSTQ6PJW8 725 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KDELC1Q6UW63 502 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TUBA1AQ71U36 451 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC91Q7Z6B0 441 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FAM160B2Q86V87 743 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 VSIG1Q86XK7 387 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 USP38Q8NB14 1042 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CD101Q93033 1021 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PEMTQ9UBM1 199 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SIX4Q9UIU6 781 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 DUSP12Q9UNI6 340 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 B4E171 279 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 H7C0S8 307 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 NDUFB4O95168 129 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 AKR1B1P15121 316 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF24P17028 368 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PTPN2P17706 415 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ELF1P32519 619 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HSPA1LP34931 641 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 NR1H2P55055 460 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ARL4CP56559 192 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ARL16Q0P5N6 197 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZBTB17Q13105 803 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TDGQ13569 410 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TNFAIP1Q13829 316 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 LCE1EQ5T753 118 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC30Q5VVM6 783 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PACS1Q6VY07 963 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TBC1D21Q8IYX1 336 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KIAA1524Q8TCG1 905 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CFAP36Q96G28 342 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 LRRC4Q9HBW1 653 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GPR34Q9UPC5 381 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM17Q9Y577 477 aa3.07□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SMARCA2P51531 1590 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PRDM2Q13029 1718 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SOCS6O14544 535 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 NDC80O14777 642 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 WNT9BO14905 357 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 AHCYL1O43865 530 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TSPAN3O60637 253 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 NDUFS7O75251 213 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SNX4O95219 450 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TGDSO95455 350 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SP1P08047 785 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 LINC00271P0C7V0 271 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ITGAXP20702 1163 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MTHFRP42898 656 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CHRNDQ07001 517 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SCARB2Q14108 478 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PDIA5Q14554 519 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MEA1Q16626 185 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms