RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YJX3 145 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJA2O60884 412 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-10P10266 1014 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-FP30511 346 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 STRA8Q7Z7C7 330 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SATL1Q86VE3 508 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF683Q8IZ20 524 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 HIPK4Q8NE63 616 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 LGMNQ99538 433 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DRC3Q9H069 523 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NMRAL1Q9HBL8 299 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC17A6Q9P2U8 582 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA1HO95180 2353 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A096LPK6 155 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP10A1A4S6 786 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN8A6NHC0 703 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 E9PBE3 544 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL41O60662 606 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTN5O94779 1100 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DGKGP49619 791 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT2P50583 147 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 FLOT2Q14254 428 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TLR1Q15399 786 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGGQ5H8A4 983 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SEL1L3Q68CR1 1132 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM215Q68D42 235 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TICAM1Q8IUC6 712 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 LZICQ8WZA0 190 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 OSBPL6Q9BZF3 934 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC6Q6W4X9 2439 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3BA6NDS4 549 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 F5H5T6 163 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TMCC1O94876 653 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMB4P28070 264 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL14P50914 215 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MTAPQ13126 283 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKAA1Q13131 559 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf27AQ580R0 203 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DSELQ8IZU8 1212 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TERB1Q8NA31 727 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF217Q8TC41 542 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 IL22Q9GZX6 179 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 BRD8Q9H0E9 1235 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NCAM2O15394 837 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD11O43934 449 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ASLP04424 464 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DRD1P21728 446 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PMLP29590 882 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF423Q2M1K9 1284 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ALFQ53S48 1182 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 GRAMD4Q6IC98 578 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CARNMT1Q8N4J0 409 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52K2Q8NGK3 314 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TSNARE1Q96NA8 513 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MPP6Q9NZW5 540 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DMTF1Q9Y222 760 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MTSS1O43312 755 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 AP2A1O95782 977 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CD70P32970 193 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NPY2RP49146 381 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM182AQ5T1J6 154 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 LIPMQ5VYY2 423 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC3Q5W041 872 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZYG11AQ6WRX3 759 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF567Q8N184 647 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTD1Q8N815 330 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCB8Q9NUT2 735 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CIDEBQ9UHD4 219 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMS3Q9UJD0 308 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 APODP05090 189 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 POLD2P49005 469 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 AIF1P55008 147 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SORCS1Q8WY21 1168 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF385DQ9H6B1 395 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB1Q9HAE3 211 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK4Q8N1I0 1966 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 AIM2O14862 343 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CRTAMO95727 393 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TFAP2AP05549 437 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 COL6A2P12110 1019 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ME2P23368 584 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NAPRTQ6XQN6 538 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CMC1Q7Z7K0 106 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX32Q86XE0 403 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CASS4Q9NQ75 786 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 OR12D3Q9UGF7 316 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa26.22■■□□□ 1.79
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