RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 RAB6CQ9H0N0 254 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 OGFRQ9NZT2 677 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 LILRA5A6NI73 299 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 A8MX80 341 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 E2F3O00716 465 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM63AO94886 807 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINA4P29622 427 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 LRP8Q14114 963 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 CNGA3Q16281 694 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 CAMK4Q16566 473 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D31Q96DN5 1066 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 DTD2Q96FN9 168 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 FAM81BQ96LP2 452 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PDFQ9HBH1 243 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 C5AR2Q9P296 337 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 COPG2Q9UBF2 871 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF185O15231 689 aa16.24■□□□□ 0.19
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SPCS1-201ENST00000233025 USP8P40818 1118 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2HP62256 183 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ART3Q13508 389 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 MIIPQ5JXC2 388 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 IYDQ6PHW0 289 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 A6NL46 340 aa16.23■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ADRA1BP35368 520 aa16.23■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ETV3P41162 512 aa16.23■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.23■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.23■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 RAET1GQ6H3X3 334 aa16.23■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa16.23■□□□□ 0.19
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SPCS1-201ENST00000233025 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.23■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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SPCS1-201ENST00000233025 NUP210LQ5VU65 1888 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 CLCN1P35523 988 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 GABRB2P47870 512 aa16.22■□□□□ 0.19
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SPCS1-201ENST00000233025 RAPSNQ13702 412 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS42Q7Z5A4 293 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 SRLQ86TD4 932 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TGM7Q96PF1 710 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.21■□□□□ 0.19
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SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 HDAC4P56524 1084 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 MAN2A1Q16706 1144 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PARP15Q460N3 678 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 IGFL3Q6UXB1 125 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM74Q86UV6 250 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 KCNMB4Q86W47 210 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 CREBRFQ8IUR6 639 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 MLKLQ8NB16 471 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
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