RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	AVL9	Q8NBF6	648 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	SCAMP4	Q969E2	229 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	AMACR	Q9UHK6	382 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	CHKB	Q9Y259	395 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PPM1D	O15297	605 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	SNX2	O60749	519 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	MAP3K6	O95382	1288 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PDHA1	P08559	390 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT7	P08729	469 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	THRA	P10827	490 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	UBASH3A	P57075	661 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	HHEX	Q03014	270 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	GALNT2	Q10471	571 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PDK2	Q15119	407 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PTPRR	Q15256	657 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PYCR3	Q53H96	274 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	TEX26	Q8N6G2	289 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	EXD3	Q8N9H8	876 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF670	Q9BS34	389 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	DDA1	Q9BW61	102 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TARDBP-231	ENST00000639599	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CLDN7	O95471	211 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FUCA1	P04066	466 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TPM3	P06753	285 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CCNC	P24863	283 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	STC1	P52823	247 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CYP4F2	P78329	520 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ZBED6	P86452	979 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PTS	Q03393	145 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NFATC2	Q13469	925 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NR1I3	Q14994	352 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TBR1	Q16650	682 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00303	Q3SY05	128 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	BORA	Q6PGQ7	559 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NLRP8	Q86W28	1048 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	DTX1	Q86Y01	620 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NCSTN	Q92542	709 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM4	Q9C037	500 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	DEF6	Q9H4E7	631 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	RMI1	Q9H9A7	625 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	VPS18	Q9P253	973 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	RP1	P56715	2156 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0U1RQS6	177 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599		A8MU76	341 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FZD6	O60353	706 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	RAD1	O60671	282 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	MTA2	O94776	668 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC4A1	P02730	911 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CYP1A2	P05177	515 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CD48	P09326	243 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ACP5	P13686	325 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FASLG	P48023	281 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FANCC	Q00597	558 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	DPYSL3	Q14195	570 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08

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