RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631166.1

HS1BP3-208, Transcript of HCLS1 binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene HS1BP3, Length 78 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HS1BP3-208	ENST00000631166	PFN3	P60673	137 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SH3BP2	P78314	561 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLC20A2	Q08357	652 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIF5A	Q12840	1032 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SGCG	Q13326	291 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	MAMLD1	Q13495	774 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	GGTLC2	Q14390	218 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	HSPB2	Q16082	182 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ISM2	Q6H9L7	571 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	COMTD1	Q86VU5	262 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SIAH3	Q8IW03	269 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	PHC3	Q8NDX5	983 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	TEKT4	Q8WW24	435 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLC6A7	Q99884	636 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRR14	Q9BWN1	585 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	HES7	Q9BYE0	225 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZMAT4	Q9H898	229 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ABCB6	Q9NP58	842 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	KLHL3	Q9UH77	587 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	GDA	Q9Y2T3	454 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SAMM50	Q9Y512	469 aa		2.07	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ASPDH	A6ND91	283 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	HIP1	O00291	1037 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	TOR1B	O14657	336 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZBTB5	O15062	677 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	TP73	O15350	636 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRMT3	O60678	531 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	NDUFS7	O75251	213 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	DDAH1	O94760	285 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	TIAF1	O95411	115 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	F10	P00742	488 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	NGF	P01138	241 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	EDN1	P05305	212 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CD63	P08962	238 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	IRF1	P10914	325 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	MMP11	P24347	488 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CDC25A	P30304	524 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CHKA	P35790	457 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ADH7	P40394	386 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	MC3R	P41968	323 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CNTN1	Q12860	1018 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	NCOA4	Q13772	614 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	MESD	Q14696	234 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	GXYLT1	Q4G148	440 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF766	Q5HY98	468 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	AGBL4	Q5VU57	503 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	FYB2	Q5VWT5	728 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	ATL3	Q6DD88	541 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	MACC1	Q6ZN28	852 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CHST9	Q7L1S5	443 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	TTC7B	Q86TV6	843 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	2.06	□□□□□ -2.08
HS1BP3-208	ENST00000631166	LZTR1	Q8N653	840 aa		2.06	□□□□□ -2.08

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