RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRY4Q9C004 299 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 INPP4BO15327 924 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF8O76064 485 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 DPTQ07507 201 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PGBD5Q8N414 524 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX19Q8NA77 164 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 NSMCE1Q8WV22 266 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MIB2Q96AX9 1013 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF31Q96EP0 1072 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCG8Q9H221 673 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO8Q9NRD0 319 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TMCO5BA8MYB1 307 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PGLSO95336 258 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 EML2O95834 649 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ESX1Q8N693 406 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAMP4Q969E2 229 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ZWILCHQ9H900 591 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PARVAQ9NVD7 372 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKAB1Q9Y478 270 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD3Q9Y597 815 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RELNP78509 3460 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MKRN2OSH3BPM6 223 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SOD1P00441 154 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 STAT5AP42229 794 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MLLT10P55197 1068 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MAMLD1Q13495 774 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC66Q68CR7 880 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFAF2Q8N183 169 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3KBP1Q96B97 665 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MGME1Q9BQP7 344 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP62CLQ9H1M0 184 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R14Q9NYV8 317 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX2O60749 519 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MIPP30301 263 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXM1Q08050 763 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9B2Q86UD5 537 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ATPAF2Q8N5M1 289 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNK6Q9Y257 313 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BRJ5 948 aa27.14■■□□□ 1.94
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CAPNS1-217ENST00000629983 PYGLP06737 847 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT7P08729 469 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 DPYSQ14117 519 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CDKAL1Q5VV42 579 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TMCO3Q6UWJ1 677 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 AGAP2Q99490 1192 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ULBP3Q9BZM4 244 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 DLSTP36957 453 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL4AP40617 200 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP13P45452 471 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 HCAR3P49019 387 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHB1P54762 984 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ITKQ08881 620 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 MARC1Q5VT66 337 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 EXD1Q8NHP7 514 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM14Q96QK8 99 aa27.13■■□□□ 1.93
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CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC172P0C7W6 258 aa27.12■■□□□ 1.93
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A4P14672 509 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHA4P54764 986 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ERV3-1Q14264 604 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
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CAPNS1-217ENST00000629983 ASB18Q6ZVZ8 466 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF765Q7L2R6 523 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PIH1D2Q8WWB5 315 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 NT5MQ9NPB1 228 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CROTQ9UKG9 612 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PDHA1P08559 390 aa27.11■■□□□ 1.93
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