RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NCSTN	Q92542	709 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CDH19	Q9H159	772 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PSMD11	O00231	422 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NKX2-8	O15522	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ZW10	O43264	779 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	MFSD11	O43934	449 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	FZD6	O60353	706 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	THRA	P10827	490 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	IL4R	P24394	825 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NFKBIA	P25963	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PRKCI	P41743	596 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ATP1A2	P50993	1020 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	DPT	Q07507	201 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0J9YYE9	177 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	DUX1	O43812	170 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	RAD1	O60671	282 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TRBC1	P01850	177 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	MYBL1	P10243	752 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ACP5	P13686	325 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CD82	P27701	267 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	NUP85	Q9BW27	656 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINC1	P01008	464 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	PRL	P01236	227 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	SFTPC	P11686	197 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINB6	P35237	376 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	STC1	P52823	247 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	HHEX	Q03014	270 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	TLE1	Q04724	770 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	BORA	Q6PGQ7	559 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	XKR5	Q6UX68	686 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	OR10G6	Q8NH81	332 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	EXD1	Q8NHP7	514 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	WDR24	Q96S15	920 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJC6	O75061	913 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	HLA-DQB2	P05538	268 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	TEAD1	P28347	426 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF165	P49910	485 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	POLE2	P56282	527 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TCF4-262	ENST00000628078	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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