RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909		A8MU76	341 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	INPP4B	O15327	924 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NKX2-8	O15522	239 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	RARA	P10276	462 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	GZMA	P12544	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CDH6	P55285	790 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PTS	Q03393	145 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PEX6	Q13608	980 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SFRP1	Q8N474	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TEX26	Q8N6G2	289 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	COX14	Q96I36	57 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SLC38A3	Q99624	504 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MAST4	O15021	2626 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909		A0A0J9YYE9	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MFSD11	O43934	449 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	DNAJC6	O75061	913 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ASMTL	O95671	621 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TRBC1	P01850	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SKIL	P12757	684 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF30	P17039	623 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SERPINB6	P35237	376 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PRKCI	P41743	596 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CCR10	P46092	362 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	STC1	P52823	247 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	RAB15	P59190	212 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	DSC2	Q02487	901 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	HHEX	Q03014	270 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ITK	Q08881	620 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NFATC2	Q13469	925 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	LRP8	Q14114	963 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	WDR24	Q96S15	920 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CLDN7	O95471	211 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PRL	P01236	227 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CD48	P09326	243 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MYBL1	P10243	752 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	IL4R	P24394	825 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MC2R	Q01718	297 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CDC20	Q12834	499 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NLRP8	Q86W28	1048 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	EXD1	Q8NHP7	514 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NCSTN	Q92542	709 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CATSPER2	Q96P56	530 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63

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