RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 SCN1AP35498 2009 aa7.96□□□□□ -1.13
ATG4D-210ENST00000588972 IGF2RP11717 2491 aa7.96□□□□□ -1.13
ATG4D-210ENST00000588972 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CCL16O15467 120 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ECI2O75521 394 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 B3GAT3O94766 335 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 SMC2O95347 1197 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 C1QTNF9P0C862 333 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 TDGF1P13385 188 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 PRCPP42785 496 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CASP4P49662 377 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 HSD11B2P80365 405 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 FOXL1Q12952 345 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 MTAPQ13126 283 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CCNIQ14094 377 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 E2F2Q14209 437 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ZBTB6Q15916 424 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 PSMD5Q16401 504 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 TTC30AQ86WT1 665 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CEP57Q86XR8 500 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 LGI4Q8N135 537 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 BEST2Q8NFU1 509 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 GPT2Q8TD30 523 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 DNASE1L2Q92874 299 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 GNRHR2Q96P88 292 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 GSDMAQ96QA5 445 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 RMND1Q9NWS8 449 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 C2CD2Q9Y426 696 aa7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 A0A087X0M5 115 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GX30 115 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF233A6NK53 670 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 PDXKO00764 312 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 EXOC3O60645 756 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CBFA2T3O75081 653 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CER1O95813 267 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 NR3C1P04150 777 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 RETP07949 1114 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CYP3A5P20815 502 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 NR2F2P24468 414 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 RBL1P28749 1068 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 PRKAR1BP31321 381 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 HTR7P34969 479 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CCR3P51677 355 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 DCAF7P61962 342 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CYP24A1Q07973 514 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 DMWDQ09019 674 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 PRKG2Q13237 762 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CSHL1Q14406 222 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 LPAL2Q16609 132 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 SPATA1Q5VX52 437 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ATG16L1Q676U5 607 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 PDXDC1Q6P996 788 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 RTL10Q7L3V2 364 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 TRABD2AQ86V40 505 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CD302Q8IX05 232 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 D2HGDHQ8N465 521 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 ASB7Q9H672 318 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.95□□□□□ -1.14
ATG4D-210ENST00000588972 DMAC2Q9NW81 257 aa7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms