RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 SQSTM1Q13501 440 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 DOK6Q6PKX4 331 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 EXD1Q8NHP7 514 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 DNAJC7Q99615 494 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 RDH14Q9HBH5 336 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 PCDH9Q9HC56 1237 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 DTLQ9NZJ0 730 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa18.18■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 ZNF487B1APH4 448 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 HGSO14964 777 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 PRAMEF10O60809 474 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 CLDN7O95471 211 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 TPM3P06753 285 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 MMP2P08253 660 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 TMEM253P0C7T8 217 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 CD82P27701 267 aa18.17■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 ACTR1AP61163 376 aa18.17■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 RAPGEF5Q92565 580 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 RNF157Q96PX1 679 aa18.17■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 NUDT22Q9BRQ3 303 aa18.17■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 VPS18Q9P253 973 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 ZNF462Q96JM2 2506 aa18.16■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa18.16■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 PPM1DO15297 605 aa18.16■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 FASLGP48023 281 aa18.16■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 TRIM14Q14142 442 aa18.16■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.16■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 CNTD1Q8N815 330 aa18.16■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 LPCAT1Q8NF37 534 aa18.16■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 ANKRD66B4E2M5 251 aa18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 PLA2G2AP14555 144 aa18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 ZBTB17Q13105 803 aa18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 QPCTQ16769 361 aa18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 OR4D9Q8NGE8 314 aa18.15■□□□□ 0.5
CTIF-206ENST00000588345 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-206ENST00000588345 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 KCNK1O00180 336 aa18.14■□□□□ 0.49
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CTIF-206ENST00000588345 JCHAINP01591 159 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 CD86P42081 329 aa18.14■□□□□ 0.49
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CTIF-206ENST00000588345 LY6DQ14210 128 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 MESDQ14696 234 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 ZFAND4Q86XD8 727 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 SFRP1Q8N474 314 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 MED8Q96G25 268 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 CCDC74BQ96LY2 380 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 DEF6Q9H4E7 631 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-206ENST00000588345 FAM83DQ9H4H8 585 aa18.14■□□□□ 0.49
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