RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	RECQL4	O94761	1208 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SUN1	O94901	812 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CCNDBP1	O95273	360 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CHRNA1	P02708	482 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	GZMA	P12544	262 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	LAMP2	P13473	410 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CD6	P30203	668 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	HTR7	P34969	479 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MAGEA1	P43355	309 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	OSTN	P61366	133 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MTF1	Q14872	753 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	NAB2	Q15742	525 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	JADE1	Q6IE81	842 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	KIF18A	Q8NI77	898 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP2A3	Q93084	1043 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF333	Q96JL9	665 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	FAR2	Q96K12	515 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB118	Q96PH6	123 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	DESI2	Q9BSY9	194 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	DPP3	Q9NY33	737 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PADI3	Q9ULW8	664 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		7.27	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A0U1RQF3	1178 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	INPPL1	O15357	1258 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	MED7	O43513	233 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIAP1	O43715	76 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	WDR47	O94967	919 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	DNTT	P04053	509 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	ITGB3	P05106	788 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	KRT19	P08727	400 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	PAEP	P09466	180 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	WEE2	P0C1S8	567 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	KRT5	P13647	590 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	CYP11B1	P15538	503 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	FGFR4	P22455	802 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	RFC2	P35250	354 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	ACTN2	P35609	894 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	TNNC1	P63316	161 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	CDR2	Q01850	454 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	ZBTB6	Q15916	424 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	GJB7	Q6PEY0	223 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	PXK	Q7Z7A4	578 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM58	Q8NG06	486 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	SPATA18	Q8TC71	538 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	HPDL	Q96IR7	371 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	UROC1	Q96N76	676 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	ASB2	Q96Q27	587 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	AGPAT1	Q99943	283 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	SYT11	Q9BT88	431 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	RMI1	Q9H9A7	625 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	RGS18	Q9NS28	235 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087X0T9	212 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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