RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	TRAF2	Q12933	501 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	LRP8	Q14114	963 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MAP7	Q14244	749 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PTPRR	Q15256	657 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	NLRP8	Q86W28	1048 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ATCAY	Q86WG3	371 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DACH1	Q9UI36	760 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	RELN	P78509	3460 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169		K7EM74	188 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PGLS	O95336	258 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	NR1D1	P20393	614 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	F8A1	P23610	371 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PSMA2	P25787	234 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	EPHA4	P54764	986 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	HHEX	Q03014	270 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DPYS	Q14117	519 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF235	Q14590	738 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	KRT31	Q15323	416 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SYCP1	Q15431	976 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	USP45	Q70EL2	814 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM74	Q86UV6	250 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ESX1	Q8N693	406 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	NCSTN	Q92542	709 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SPTB	P11277	2137 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169		A0A0U1RQS6	177 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169		A6NCN8	305 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DNAJC6	O75061	913 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PYGL	P06737	847 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MLLT10	P55197	1068 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TEX19	Q8NA77	164 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	COX14	Q96I36	57 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CD84	Q9UIB8	345 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MAFK	O60675	156 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PDHA1	P08559	390 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	KRT7	P08729	469 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CTPS1	P17812	591 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MIP	P30301	263 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MAX	P61244	160 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PTS	Q03393	145 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	NFATC2	Q13469	925 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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