RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	GRAP	Q13588	217 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF273	Q14593	569 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	VSTM1	Q6UX27	236 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RUFY3	Q7L099	469 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KBTBD6	Q86V97	674 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR63	Q8IWG1	891 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ARRDC3	Q96B67	414 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HDAC11	Q96DB2	347 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG14	Q96F25	216 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf74	Q96LT6	269 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MEIS3	Q99687	375 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TXN2	Q99757	166 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT23	Q9C075	422 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC32A1	Q9H598	525 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL17	Q9UF56	701 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IL17B	Q9UHF5	180 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FZD4	Q9ULV1	537 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RCE1	Q9Y256	329 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NFS1	Q9Y697	457 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PRV1	198 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ENO4	A6NNW6	628 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CLIC1	O00299	241 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SYN3	O14994	580 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MCF2L	O15068	1137 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANGPT2	O15123	496 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LDLRAD4	O15165	306 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMDEC1	O15204	470 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB43	O43298	467 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HCRTR2	O43614	444 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF2	O60811	474 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SMPD2	O60906	423 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	AVIL	O75366	819 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXB5	P09067	269 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IGFBP2	P18065	325 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	YY1	P25490	414 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN3	P26045	913 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NTSR1	P30989	418 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA4	P34932	840 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CCR10	P46092	362 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MTNR1A	P48039	350 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNAR2	P48551	515 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPZA1	P52907	286 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ARFIP1	P53367	373 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NAGLU	P54802	743 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXL2	P58012	376 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1024L	P59773	190 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ10	P78508	379 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PPAT	Q06203	517 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RALGDS	Q12967	914 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MTAP	Q13126	283 aa		2.85	□□□□□ -1.95

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