RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 CREMQ03060 361 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TWF1Q12792 350 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMARCB1Q12824 385 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDK2Q15119 407 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R7Q15435 360 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHHQ15465 462 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 BOLA3Q53S33 107 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 C10orf120Q5SQS8 335 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSTA5Q7RTV2 222 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP7D3Q8IWC1 876 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCML4Q8N228 414 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGAP18Q8N392 663 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNX33Q8WV41 574 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CASP10Q92851 521 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBTB9Q96C00 473 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATA17Q96L03 361 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 NEU1Q99519 415 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM62Q9BVG3 475 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TKTL2Q9H0I9 626 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 WDCPQ9H6R7 721 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CERS4Q9HA82 394 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABCC13Q9NSE7 274 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 OSER1Q9NX31 292 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 RRN3Q9NYV6 651 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNPEPQ9ULA0 475 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHROOM3Q8TF72 1996 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 UNC119BA6NIH7 251 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 HIDE1A8MVS5 230 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM72CH0Y354 149 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 H7C0C1 242 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SGK1O00141 431 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MCF2LO15068 1137 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 IRAK2O43187 625 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 LIASO43766 372 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDM1AO60341 852 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERLIN1O75477 346 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ENDOD1O94919 500 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABLIM3O94929 683 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBX18O95935 607 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 F9P00740 461 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CA3P07451 260 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC00271P0C7V0 271 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 HKR1P10072 659 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTSAP10619 480 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 IRF1P10914 325 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ETS1P14921 441 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MCM3P25205 808 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAJB1P25685 340 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLRC2P26717 231 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATP5OP48047 213 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FNTAP49354 379 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCNN1BP51168 640 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TPI1P60174 286 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TP53BP2Q13625 1128 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TFDP2Q14188 446 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 VEPH1Q14D04 833 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 BRD3Q15059 726 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRADDQ15628 312 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 DPYSL2Q16555 572 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCNG2Q16589 344 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP1B1Q16678 543 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM182AQ5T1J6 154 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TPGS2Q68CL5 300 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMCO3Q6UWJ1 677 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 BBS12Q6ZW61 710 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 BNIPLQ7Z465 357 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRUNE1Q86TP1 453 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MON1AQ86VX9 555 aa5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms