RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC25A12	O75746	678 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PDE1B	Q01064	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	FOXM1	Q08050	763 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591		M0QZ24	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SPINT2	O43291	252 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	JRK	O75564	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ISL1	P61371	349 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CDC16	Q13042	620 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	BUB3	O43684	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	KCNK5	O95279	499 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	LAMP2	P13473	410 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	MYOD1	P15172	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	ITGA2	P17301	1181 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	HOXC9	P31274	260 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	ARL3	P36405	182 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	FUT6	P51993	359 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF132	P52740	706 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	GALC	P54803	685 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	TAS2R38	P59533	333 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	DCAF7	P61962	342 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	NAB2	Q15742	525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	DCST1	Q5T197	706 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	USP6NL	Q92738	828 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	TTC14	Q96N46	770 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CFAP54-208	ENST00000556591	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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