RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 LRP6O75581 1613 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF30P17039 623 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 MYL9P24844 172 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 AVPR1BP47901 424 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GRIK5Q16478 980 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 AMER2Q8N7J2 671 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PSKH2Q96QS6 385 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SH3GL2Q99962 352 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CEP41Q9BYV8 373 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 NR2E1Q9Y466 385 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PRORSD1PA6NEY8 169 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FPGTO14772 594 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 VIPP01282 170 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 KCNE1P15382 129 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CDKN2BP42772 138 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CHN2P52757 468 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SFRP1Q8N474 314 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SEPHS2Q99611 448 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 RFXANKO14593 260 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PDE5AO76074 875 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 NSG1P42857 185 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 WDR48Q8TAF3 677 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 HDAC10Q969S8 669 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SGK2Q9HBY8 427 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PLLPQ9Y342 182 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ILVBLA1L0T0 632 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 KERAO60938 352 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CYP7B1O75881 506 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GNSP15586 552 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CUZD1Q86UP6 607 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PDPRQ8NCN5 879 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SLCO2A1Q92959 643 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CAPN14A8MX76 684 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 C1RP00736 705 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SLC26A3P40879 764 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CACNA2D1P54289 1103 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 NR1H2P55055 460 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 RAB25P57735 213 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R40P59535 323 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PTSQ03393 145 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 HERC3Q15034 1050 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CYP1B1Q16678 543 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00471Q8N535 108 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CRELD1Q96HD1 420 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FCRL5Q96RD9 977 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 XPR1Q9UBH6 696 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 INHAP05111 366 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FAM153BP0C7A2 387 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ACADLP28330 430 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 IGFALSP35858 605 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 BRCC3P46736 316 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 DGKGP49619 791 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SUOXP51687 545 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SP140Q13342 867 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms