RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 IFI44Q8TCB0 444 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM172AQ8WUF8 416 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CPT1BQ92523 772 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NT5C3BQ969T7 300 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RGMAQ96B86 450 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TBCBQ99426 244 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PKMYT1Q99640 499 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MYOCQ99972 504 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SYT15Q9BQS2 421 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TRPV6Q9H1D0 765 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 KCNH6Q9H252 994 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RSAD1Q9HA92 442 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 USP29Q9HBJ7 922 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PCDH9Q9HC56 1237 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RGS18Q9NS28 235 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.57□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CDH9Q9ULB4 789 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FZD10Q9ULW2 581 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MCM3APO60318 1980 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 A6NNZ2 444 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZNF487B1APH4 448 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 M0QZQ0 153 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MDM4O15151 490 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DAB1O75553 588 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TCEA3O75764 348 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DDHD2O94830 711 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 CKBP12277 381 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CAPN2P17655 700 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NR1D1P20393 614 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 STIP1P31948 543 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MDH1P40925 334 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MATKP42679 507 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 IL12RB1P42701 662 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 CDK7P50613 346 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TKTL1P51854 596 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 MAP3K7CLP57077 242 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TFDP2Q14188 446 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GRM3Q14832 879 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 FAM182AQ5T1J6 154 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SYPL2Q5VXT5 272 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 STRADAQ7RTN6 431 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 SPATA18Q8TC71 538 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RAET1EQ8TD07 263 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PGM2Q96G03 612 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PCED1BQ96HM7 432 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 KCNK16Q96T55 309 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NPY6RQ99463 290 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MED10Q9BTT4 135 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MRI1Q9BV20 369 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
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