RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 DPEP2Q9H4A9 486 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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CLSTN3-215ENST00000544584 CYP4F12Q9HCS2 524 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 THSD1Q9NS62 852 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 VPS18Q9P253 973 aa5.59□□□□□ -1.51
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CLSTN3-215ENST00000544584 RSPH14Q9UHP6 348 aa5.59□□□□□ -1.51
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CLSTN3-215ENST00000544584 FGF1P05230 155 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 DCDC1P59894 354 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 PCSK7Q16549 785 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF542PQ5EBM4 170 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LDLRAP1Q5SW96 308 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CRTC1Q6UUV9 634 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZVL8 140 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 PIM3Q86V86 326 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 PGBD5Q8N414 524 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 NETO2Q8NC67 525 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM58Q8NG06 486 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 FGF11Q92914 225 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 OLFM3Q96PB7 478 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 FCRL5Q96RD9 977 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 CMKLR1Q99788 373 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 C19orf43Q9BQ61 176 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC61Q9BV99 259 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 OSBPL8Q9BZF1 889 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 VPS37BQ9H9H4 285 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 APPL1Q9UKG1 709 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RAXQ9Y2V3 346 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0G2JNG1 304 aa5.57□□□□□ -1.52
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