RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-209ENST00000534197 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 CBX8Q9HC52 389 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 NENFQ9UMX5 172 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 SPTA1P02549 2419 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 MYO1FO00160 1098 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 INPP4BO15327 924 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 CLDN7O95471 211 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 HLA-DQB2P05538 268 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 GPR3P46089 330 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 LIMK2P53671 638 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 NFKBIBQ15653 356 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 WDR24Q96S15 920 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 CDH19Q9H159 772 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 SEPT10Q9P0V9 454 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GNPTG-209ENST00000534197 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 MATN3O15232 486 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 GBE1Q04446 702 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 NLRP8Q86W28 1048 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 PQLC3Q8N755 202 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 PRKAB1Q9Y478 270 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 TTLL3Q9Y4R7 772 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 DNAJC6O75061 913 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 GYPCP04921 128 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 THRAP10827 490 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF30P17039 623 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ITGB6P18564 788 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 EPHB1P54762 984 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ZBED6P86452 979 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 NFATC3Q12968 1075 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 BIRC2Q13490 618 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF765Q7L2R6 523 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 OR4D9Q8NGE8 314 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 SLC37A2Q8TED4 501 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 TSGA13Q96PP4 275 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 SLC28A2O43868 658 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 MMP2P08253 660 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 FAM87AP0C7U9 286 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 CCNCP24863 283 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 CD82P27701 267 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 UBASH3AP57075 661 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 NFKB2Q00653 900 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 SQSTM1Q13501 440 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 KCTD6Q8NC69 237 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 LPCAT1Q8NF37 534 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 EXD1Q8NHP7 514 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 FAF2Q96CS3 445 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 TAAR9Q96RI9 348 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 B3GNT4Q9C0J1 378 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 OCIAD1Q9NX40 245 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 SYCE3A1L190 88 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 FADS2P1A8MWK0 482 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ITGB2P05107 769 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 FASLGP48023 281 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 TBR1Q16650 682 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 GALNT13Q8IUC8 556 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 NRSN1Q8IZ57 195 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 SFRP1Q8N474 314 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ART4Q93070 314 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 FATE1Q969F0 183 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 NKD1Q969G9 470 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 LYSMD1Q96S90 227 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF670Q9BS34 389 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 STMND1H3BQB6 276 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 PROSCO94903 275 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ASMTLO95671 621 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 QPCTQ16769 361 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 TMEM164Q5U3C3 297 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 RAPGEF5Q92565 580 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 EID2BQ96D98 161 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 STARD5Q9NSY2 213 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 TBC1D29Q9UFV1 150 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTG-209ENST00000534197 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms