RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.63■■□□□ 1.21
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TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM159BA6NKW6 160 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1I1O60431 355 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 STX2P32856 288 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 IGFALSP35858 605 aa22.58■■□□□ 1.2
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