RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa30.02■■■□□ 2.4
ALYREF-202ENST00000505490 FLNCQ14315 2725 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 PPFIA2O75334 1257 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 STC1P52823 247 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 TYRO3Q06418 890 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC112Q8NEF3 446 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 ART4Q93070 314 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 FATE1Q969F0 183 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 SMIM14Q96QK8 99 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 AGAP2Q99490 1192 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM4Q9C037 500 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 CD84Q9UIB8 345 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 GOLGA6CA6NDK9 693 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 GOLGA6BA6NDN3 693 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 GOLGA6DP0CG33 693 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 DOK6Q6PKX4 331 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 NRSN1Q8IZ57 195 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 NDUFAF2Q8N183 169 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 SLC37A2Q8TED4 501 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 LYSMD1Q96S90 227 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 NT5MQ9NPB1 228 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 OCIAD1Q9NX40 245 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 COL12A1Q99715 3063 aa30■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1B0GTH6 734 aa29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 DNAJC6O75061 913 aa29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 PRLP01236 227 aa29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 LIFP15018 202 aa29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 BIRC2Q13490 618 aa29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 VPS18Q9P253 973 aa29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 PILRAQ9UKJ1 303 aa29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 EML2O95834 649 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 SKILP12757 684 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 ARSEP51690 589 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 RAB15P59190 212 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 GALNT2Q10471 571 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 FIGNQ5HY92 759 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC183Q5T5S1 534 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 HGSNATQ68CP4 663 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 BORAQ6PGQ7 559 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM74Q86UV6 250 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 EXD1Q8NHP7 514 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 WDR24Q96S15 920 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 SLC39A1Q9NY26 324 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 AMACRQ9UHK6 382 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 TUBD1Q9UJT1 453 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 DNPEPQ9ULA0 475 aa29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 CES1P23141 567 aa29.97■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 MPSTP25325 297 aa29.97■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 GARSP41250 739 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 GALNT13Q8IUC8 556 aa29.97■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 A6NCN8 305 aa29.96■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 DCAF12Q5T6F0 453 aa29.96■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa29.96■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 IL22RA1Q8N6P7 574 aa29.96■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 ARRDC2Q8TBH0 407 aa29.96■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 TSGA13Q96PP4 275 aa29.96■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 GBP4Q96PP9 640 aa29.96■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 RELNP78509 3460 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 EFCAB7A8K855 629 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 MATN3O15232 486 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 MFSD11O43934 449 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 RAD1O60671 282 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 CD48P09326 243 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 RPL26P61254 145 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 MC2RQ01718 297 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 MMRN1Q13201 1228 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 ANO6Q4KMQ2 910 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 FILIP1LQ4L180 1135 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 ANKS6Q68DC2 871 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 OR10G6Q8NH81 332 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 RTP4Q96DX8 246 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 SLC45A3Q96JT2 553 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 THAP2Q9H0W7 228 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 IP6K2Q9UHH9 426 aa29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
ALYREF-202ENST00000505490 DUX1O43812 170 aa29.94■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 NR1I3Q14994 352 aa29.94■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa29.94■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 IYDQ6PHW0 289 aa29.94■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 BTBD6Q96KE9 485 aa29.94■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 SLC38A3Q99624 504 aa29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms