RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491711.5

PDSS1-204, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDSS1, Length 897 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-204ENST00000491711 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 CASP4P49662 377 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 NFYCQ13952 458 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 ODF1Q14990 250 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 UGT8Q16880 541 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 MPPE1Q53F39 396 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 FBLN7Q53RD9 439 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 USP30Q70CQ3 517 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 CHST9Q7L1S5 443 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 UNC93AQ86WB7 457 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 WDR48Q8TAF3 677 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 WDR92Q96MX6 357 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 MENTQ9BUN1 341 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 SDCBP2Q9H190 292 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 OR10A2Q9H208 303 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 TMEM245Q9H330 911 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 GGA2Q9UJY4 613 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 SCML1Q9UN30 329 aa6.7□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 LGALS16A8MUM7 142 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 ALG1L2C9J202 215 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 HHLA1C9JL84 531 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 GPR42O15529 346 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 KLKB1P03952 638 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 SKILP12757 684 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 C6P13671 934 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 CD38P28907 300 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 HLA-FP30511 346 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 PBX1P40424 430 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 ST8SIA6P61647 398 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 UBXN1Q04323 297 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 MUM1Q2TAK8 710 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 TMEM215Q68D42 235 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 PCSK4Q6UW60 755 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 GPR135Q8IZ08 494 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 LGI4Q8N135 537 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 C12orf29Q8N999 325 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 SAP25Q8TEE9 199 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 RFFLQ8WZ73 363 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 WBP1Q96G27 269 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 P2RY11Q96G91 374 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 GNRHR2Q96P88 292 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 GPHA2Q96T91 129 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 SCOCQ9UIL1 159 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 FZD4Q9ULV1 537 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.68□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 A0A1W2PR48 441 aa6.68□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.68□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 B8ZZF3 427 aa6.68□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDSS1-204ENST00000491711 PDXKO00764 312 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms