RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491013.5

FDPS-216, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene FDPS, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-216ENST00000491013 CAMK2BQ13554 666 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 TCEA2Q15560 299 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 HES3Q5TGS1 186 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 IFI44Q8TCB0 444 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 CDH19Q9H159 772 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GBA3Q9H227 469 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 RAD18Q9NS91 495 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 SUFUQ9UMX1 484 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 APC2O95996 2303 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.61□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 CPED1A4D0V7 1026 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 F5H423 210 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 KCNN4O15554 427 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 OPA1O60313 960 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 ANXA9O76027 345 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 CAPNS1P04632 268 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 HLA-DPA1P20036 260 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 POLD2P49005 469 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GEMP55040 296 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 CLDN6P56747 220 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 DCDC1P59894 354 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 SLC1A5Q15758 541 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GUSBP11Q6P575 273 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 ARL10Q8N8L6 244 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GPR26Q8NDV2 337 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 IPMKQ8NFU5 416 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 NAT6Q93015 286 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 SPATA13Q96N96 652 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 TRABDQ9H4I3 376 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 PADI4Q9UM07 663 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GPR34Q9UPC5 381 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.6□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 C5orf60A6NFR6 353 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 AURKAO14965 403 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 INPP4BO15327 924 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 NRDCO43847 1150 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 HMGCLP35914 325 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GNPDA1P46926 289 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 DOK6Q6PKX4 331 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 TRIM74Q86UV6 250 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 NRROSQ86YC3 692 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 KYQ8NBH2 561 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GPR156Q8NFN8 814 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 HACD3Q9P035 362 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 VPS18Q9P253 973 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GULP1Q9UBP9 304 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FDPS-216ENST00000491013 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 MT-CO3P00414 261 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 FGF1P05230 155 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 BPIP17213 487 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 PSMB4P28070 264 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 ADRA1AP35348 466 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 ADCY8P40145 1251 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 CHRNA4P43681 627 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.084e-8■■■□□ 18.4
FDPS-216ENST00000491013 PRPSAP1Q14558 356 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 RPS6KA1Q15418 735 aa14.58□□□□□ -0.08
FDPS-216ENST00000491013 PYCR3Q53H96 274 aa14.58□□□□□ -0.08
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