RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TLL1O43897 1013 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR2B3O76000 313 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CFHP08603 1231 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNA6P17658 529 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDKN2BP42772 138 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAP2K6P52564 334 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 OLR1P78380 273 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AANATQ16613 207 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AOC3Q16853 763 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF404Q494X3 552 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRR16Q569H4 304 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 C12orf60Q5U649 245 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMC2Q8TDI7 906 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 APBB2Q92870 758 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LPPQ93052 612 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LGALS12Q96DT0 336 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOPNLQ96NB1 174 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SARDHQ9UL12 918 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 COPS3Q9UNS2 423 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP22Q9UPT9 525 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDE10AQ9Y233 779 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CACNA1SQ13698 1873 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIP2BQ9P265 1576 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A0B4J293 547 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PRG6 482 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC78A2IDD5 438 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 H0YAE9 185 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC22A2O15244 555 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLRA3O75311 464 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATG7O95352 703 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP3A7P24462 503 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LTKP29376 864 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD6P30203 668 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM23P36406 574 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GZMKP49863 264 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAMLD1Q13495 774 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF273Q14593 569 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LTB4RQ15722 352 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR68Q15743 365 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NFIL3Q16649 462 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PYCR3Q53H96 274 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 REP15Q6BDI9 236 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CES5AQ6NT32 575 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NLRP8Q86W28 1048 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB43Q86YS6 212 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF31Q96EP0 1072 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LXNQ9BS40 222 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MMP28Q9H239 520 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD93Q9NPY3 652 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC12A8A0AV02 714 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGEF9O43307 516 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC22A5O76082 557 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NPR3P17342 541 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DSG3P32926 999 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPMTP51580 245 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC7A2P52569 658 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DEFA1P59665 94 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DEFA3P59666 94 aa6.87□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms