RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV3-27P01718 113 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHOCP08134 193 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAMP19021 973 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCR3P51677 355 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1QTNF8P60827 252 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTKQ06187 659 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRF1Q16656 503 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSTA3Q16772 222 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC26Q2I0M4 334 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL21CQ5VZV1 264 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ESAMQ96AP7 390 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INSIG1O15503 277 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1RP00736 705 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PMLP29590 882 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRIA2P42262 883 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTK2BQ14289 1009 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC8B1Q6J4K2 584 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAOXQ6QHF9 649 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMYD1Q8NB12 490 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALPQ9UBC7 116 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX28O15482 410 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF11O60813 436 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXD12P35452 270 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OXCT1P55809 520 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTEHQ6S545 545 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A17Q8WUG5 538 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKP2Q99959 881 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DRGXA6NNA5 263 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TARM1B6A8C7 271 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H0Y626 953 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H3BNC9 293 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDHDO14521 159 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFB5O43674 189 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX1O43933 1283 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLR1Q15399 786 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEATR9A2RTY3 570 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR1I1O60431 355 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALPIP09923 528 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ME2P23368 584 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC11A2P49281 568 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SULT2A1Q06520 285 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRAMD4Q6IC98 578 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LILRA2Q8N149 483 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABHD8Q96I13 439 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA17Q96L03 361 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YME1L1Q96TA2 773 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS45Q9NRW7 570 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A8MT66 165 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQCF5A8MTL0 148 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL10RBQ08334 325 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CUZD1Q86UP6 607 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RDH11Q8TC12 318 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms