RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	URAD	A6NGE7	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNK5	O95279	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KRT3	P12035	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CTNNA2	P26232	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CASP1	P29466	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC8A1	P32418	973 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CASP6	P55212	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TPI1	P60174	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CRYM	Q14894	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ADAM32	Q8TC27	787 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CIT	O14578	2027 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	METTL12	A8MUP2	240 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ALPI	P09923	528 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	OR1E1	P30953	314 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	OPRD1	P41143	372 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	HTR3A	P46098	478 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RHOA	P61586	193 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261		Q6ZS52	159 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ACACB	O00763	2458 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	HR	O43593	1189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	USP1	O94782	785 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	AKR7A3	O95154	331 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	GPD1	P21695	349 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SERPINA4	P29622	427 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ILK	Q13418	452 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MED22	Q15528	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CST6	Q15828	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PHF12	Q96QT6	1004 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms