RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 SPRY4Q9C004 299 aa9.4□□□□□ -0.9
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM7Q9C029 511 aa9.4□□□□□ -0.9
SMARCE1-210ENST00000481231 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.4□□□□□ -0.9
SMARCE1-210ENST00000481231 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.4□□□□□ -0.9
SMARCE1-210ENST00000481231 MAP10Q9P2G4 905 aa9.4□□□□□ -0.9
SMARCE1-210ENST00000481231 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.4□□□□□ -0.9
SMARCE1-210ENST00000481231 ST14Q9Y5Y6 855 aa9.4□□□□□ -0.9
SMARCE1-210ENST00000481231 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SMARCE1-210ENST00000481231 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.4□□□□□ -0.91
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SMARCE1-210ENST00000481231 CD1CP29017 333 aa9.39□□□□□ -0.91
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SMARCE1-210ENST00000481231 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
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SMARCE1-210ENST00000481231 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.39□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
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SMARCE1-210ENST00000481231 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.39□□□□□ -0.91
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SMARCE1-210ENST00000481231 PMS2P54278 862 aa9.38□□□□□ -0.91
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SMARCE1-210ENST00000481231 ABHD18Q0P651 414 aa9.38□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAF2Q12933 501 aa9.38□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF235Q14590 738 aa9.38□□□□□ -0.91
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SMARCE1-210ENST00000481231 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.38□□□□□ -0.91
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SMARCE1-210ENST00000481231 SLC34A3Q8N130 599 aa9.38□□□□□ -0.91
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SMARCE1-210ENST00000481231 POLHQ9Y253 713 aa9.38□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.38□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.38□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.37□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.37□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GTL3 188 aa9.37□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PQ67 120 aa9.37□□□□□ -0.91
SMARCE1-210ENST00000481231 CDC14CA4D256 554 aa9.37□□□□□ -0.91
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