RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PDXP	Q96GD0	296 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	HIC2	Q96JB3	615 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	LRRC61	Q9BV99	259 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	CASS4	Q9NQ75	786 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	KL	Q9UEF7	1012 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PKP3	Q9Y446	797 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	ARL5A	Q9Y689	179 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PI4KA	P42356	2102 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PRSS38	A1L453	326 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	C2orf81	A6NN90	581 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC188	H7C350	402 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	AQP9	O43315	295 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	LDB2	O43679	373 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	ECEL1	O95672	775 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	GAS8	O95995	478 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	CEACAM5	P06731	702 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	IVL	P07476	585 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	GIMD1	P0DJR0	217 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	CEACAM1	P13688	526 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TPSB2	P20231	275 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PSMA3	P25788	255 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	GRIA1	P42261	906 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PAFAH1B1	P43034	410 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	LMAN1	P49257	510 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	CDK16	Q00536	496 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	KCNJ11	Q14654	390 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TPSAB1	Q15661	275 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	ALS2CL	Q60I27	953 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TRIM74	Q86UV6	250 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	HID1	Q8IV36	788 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SLC25A45	Q8N413	288 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	DEFB124	Q8NES8	71 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	VPS35	Q96QK1	796 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SLC32A1	Q9H598	525 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	IL26	Q9NPH9	171 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SMOX	Q9NWM0	555 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	VPS18	Q9P253	973 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SPAST	Q9UBP0	616 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	KCTD3	Q9Y597	815 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM131	Q92545	1883 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	MROH6	A6NGR9	719 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887		H7C0S8	307 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	SCAMP1	O15126	338 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	INPP4B	O15327	924 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	KCNK5	O95279	499 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	FUCA1	P04066	466 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TPH1	P17752	444 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	HADHA	P40939	763 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	VPS41	P49754	854 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	XIAP	P98170	497 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	GPS1	Q13098	491 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PTK6	Q13882	451 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PTPRCAP	Q14761	206 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	POU6F1	Q14863	301 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF534	Q76KX8	674 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SFI1-222	ENST00000478887	GLRX5	Q86SX6	157 aa		9.41	□□□□□ -0.9

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