RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334		A6NCN8	305 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334		A8MZ25	164 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334		M0QZ24	198 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	SCAMP1	O15126	338 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	VILL	O15195	856 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	MID1	O15344	667 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	RFPL2	O75678	378 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	OR2C1	O95371	312 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	RRM1	P23921	792 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	HOXC9	P31274	260 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	CASP2	P42575	452 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	PRCP	P42785	496 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	CLCNKA	P51800	687 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	ART1	P52961	327 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	TAS2R40	P59535	323 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	CDC16	Q13042	620 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	PCYT2	Q99447	389 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBM39-231	ENST00000477334	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	SPINT2	O43291	252 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	GFPT2	O94808	682 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	KCNK5	O95279	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	PMS2P2	O95744	297 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	RB1	P06400	928 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	HOXD13	P35453	343 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	ZBED6	P86452	979 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	TFAP4	Q01664	338 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	MC1R	Q01726	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	SNTA1	Q13424	505 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	KEAP1	Q14145	624 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	MEA1	Q16626	185 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	DCST1	Q5T197	706 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	GAD1	Q99259	594 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	MEIS3	Q99687	375 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-231	ENST00000477334	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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