RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 CD1DP15813 335 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 SOX11P35716 441 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 GNA12Q03113 381 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 LIPEQ05469 1076 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 NR1D2Q14995 579 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 GRAMD4Q6IC98 578 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 PDPRQ8NCN5 879 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 SNX19Q92543 992 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 VPS33AQ96AX1 596 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 TEX37Q96LM6 180 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 MUS81Q96NY9 551 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 ARNT2Q9HBZ2 717 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 ATP13A1Q9HD20 1204 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 USP22Q9UPT9 525 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 WDR37Q9Y2I8 494 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 A0A1B0GTL3 188 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 H0YAE9 185 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 PTGESO14684 152 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 NOL3O60936 208 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 LDLRP01130 860 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 ALDH2P05091 517 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 LINC00032P0C843 101 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 LBPP18428 481 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 DIO3P55073 304 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 GEN1Q17RS7 908 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 TUBGCP3Q96CW5 907 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 CSF3RQ99062 836 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 KATNBL1Q9H079 304 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 NANOGQ9H9S0 305 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 BTRCQ9Y297 605 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 GPR45Q9Y5Y3 372 aa10.32□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 A0A1W2PP18 115 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 DYTNA2CJ06 578 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 MMP3P08254 477 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 UMPSP11172 480 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 MTHFD2P13995 350 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 HRH2P25021 359 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 HOXC13P31276 330 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 SHMT2P34897 504 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 ARSDP51689 593 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 NFYCQ13952 458 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 OR4D1Q15615 310 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 ITIH5Q86UX2 942 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 SLC35B4Q969S0 331 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 GLT1D1Q96MS3 346 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM74Q96NL1 305 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 ASB2Q96Q27 587 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 TSPAN18Q96SJ8 248 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 VTA1Q9NP79 307 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 IPPQ9Y573 584 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 DOCK4Q8N1I0 1966 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 OR51F1A6NGY5 319 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 CFAP99D6REC4 459 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 UBXN8O00124 270 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 KPNA6O60684 536 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 BCL10O95999 233 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 IGLV3-25P01717 112 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 RCAN2Q14206 197 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 MANEALQ5VSG8 457 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 SENP8Q96LD8 212 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 SEPHS2Q99611 448 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 C1orf50Q9BV19 199 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 LHPPQ9H008 270 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 SLAMF8Q9P0V8 285 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 CRYL1Q9Y2S2 319 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 PATJQ8NI35 1801 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 DNAH12Q6ZR08 3092 aa10.3□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 PTPRDP23468 1912 aa10.3□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 CLPXO76031 633 aa10.3□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 CES1P23141 567 aa10.3□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 RXRGP48443 463 aa10.3□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 RPS6KA2Q15349 733 aa10.3□□□□□ -0.76
LINC00886-201ENST00000472943 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms